近日，《自然—通訊》在線發表了武漢大學生命科學學院教授吳旻、武漢大學中南醫院消化內科教授葉梅團隊在結直腸癌全基因組圖譜分析方面的最新成果。團隊研究建立了結直腸癌臨床組織的全面的活性增強子圖譜，鑒定出10多個超級增強子在結直腸癌中的作用，發現調控PHF19和TBC1D16的超級增強子是致癌的超級增強子，揭示KLF3是一個新的結直腸癌致癌轉錄因子，為結直腸癌研究提供了重要表觀基因組數據和新的關鍵調控因子。

結直腸癌是世界上發病率和死亡率最高的惡性腫瘤之一。近期的表觀遺傳組學研究發現，增強子活性增強是多種癌癥的共同特征之一，可能作為癌癥診斷和治療的新靶點。

在這項工作中，研究者獲得了147個H3K27ac ChIP-Seq、144個RNA-Seq、147個全基因組測序和86個H3K4me3 ChIP-Seq樣本，在結直腸癌病人組織中鑒定出了5590個獲得的差異增強子位點和1100個缺失的差異增強子位點、334個獲得的差異超級增強子位點(gain VSELs)和121個缺失的差異超級增強子位點。

研究者驗證了10個gain VSELs在結直腸癌細胞系中的功能，抑制VSELs的活性能顯著抑制臨近靶基因的表達以及結直腸癌細胞的遷移能力，其中抑制超級增強子PHF19和TBC1D16有效抑制了結直腸癌細胞的裸鼠成瘤能力。

研究者還預測了結直腸癌中的多個關鍵轉錄因子，并發現抑制轉錄因子KLF3的表達，可有效抑制結直腸癌細胞的遷移能力以及裸鼠成瘤能力，證明KLF3是一個新的促進結直腸癌的轉錄因子。(記者溫才妃)

關鍵詞： 武漢大學 結直腸癌 新致癌轉錄因子 結直腸癌全基因組圖譜