中山大學生命科學學院施蘇華/何子文課題組利用大規?；蚪M數據，探究紅樹植物的起源、進化及其對全球變化的響應。相關研究近日發表于《自然—生態與演化》。該研究首次以一個同資源種團為研究對象開展大規?；蚪M學研究，為生態與進化基因組學開辟了新的研究范式。

研究人員通過最新的第三代測序技術從頭測序組裝了40余種紅樹及近緣陸生植物的高質量基因組，結合已發表的其他序列，重建了涵蓋所有現存紅樹物種的系統發育關系。

系統發育基因組的分析結果表明，紅樹的起源時間并不局限于以往認識的少數幾個時間窗口，而是在數千萬年里陸續發生了27次獨立起源事件。進一步分析發現，紅樹與其他陸生植物相比，其物種增長速率要小得多。這暗示了紅樹物種在潮間帶極端環境中的脆弱性，在歷史上可能經歷過多次物種滅絕事件。目前發現的幾個紅樹滅絕種的化石支持這一假說。

為進一步驗證紅樹植物在全球氣候變化下是否足夠強健，研究人員對現存紅樹物種的歷史群體大小動態變化進行分析，發現大多數紅樹物種在海平面快速變化時期發生了種群規模急劇減少和破碎分化。這說明雖然紅樹植物具有一定程度的潮間帶環境適應性，但在面對氣候快速變化過程中仍具有相當的脆弱性，導致部分紅樹物種在歷史上發生滅絕。在如今全球氣候變暖、海平面上升和人類活動日益增加的多重沖擊下，紅樹林生態系統正面臨著更嚴重的威脅，熱帶海岸生態系統可能會出現不可逆轉的生物多樣性減少。

該研究通過大規模系統發育基因組學數據分析，厘清了紅樹植物的27次獨立起源，解析了紅樹適應性進化過程及其對全球氣候變化的響應，揭示了“占據全球熱帶海岸的紅樹植物物種數量為什么這么少”這一謎團，為應對全球氣候變化、保護海岸帶生態系統提供理論依據。(朱漢斌)

關鍵詞： 全球熱帶海岸紅樹物種數量 大規?；蚪M數據 近緣陸生植物 紅樹植物的起源