中國水產(chǎn)科學(xué)研究院長江水產(chǎn)研究所(以下簡稱長江所)的科研人員發(fā)現(xiàn)，長江野生魚腸道內(nèi)微生物主要來自與魚類食性相關(guān)的環(huán)境微生物，它們大多只是匆匆過客(暫住者)，和宿主形成穩(wěn)定適應(yīng)的常住者相比占比很低。相關(guān)研究成果近日發(fā)表于《微生物學(xué)前沿》。

為了系統(tǒng)理解腸道微生物和環(huán)境微生物之間的動態(tài)關(guān)系，長江所科研人員提出了一個簡化的框架來描述腸道微生物的定殖和動態(tài)。水生動物在個體發(fā)育早期，環(huán)境微生物隨水體環(huán)境和餌料一起通過攝食過程進入腸道。隨著個體發(fā)育和免疫系統(tǒng)建立，一小部分進入腸道的微生物和宿主之間逐漸建立協(xié)同平衡成為腸道微生物定居者，而大部分進入腸道的環(huán)境微生物只是匆匆過客，因腸道內(nèi)環(huán)境及免疫過程的過濾而消失或在腸道微生物群落動態(tài)競爭演替中消失。所以在成年個體腸道中，微生物是由不斷進入腸道的環(huán)境微生物和已定居腸道的微生物組成的。

為了量化環(huán)境微生物在野生魚類腸道的定殖狀況，研究人員利用16S rRNA基因擴增子測序，對長江武漢段水體環(huán)境微生物和10種野生魚類腸道微生物的群落結(jié)構(gòu)進行分析，量化環(huán)境微生物和腸道內(nèi)微生物之間的關(guān)系。

結(jié)果確認，在大多數(shù)個體中，近80%的腸道微生物和水體環(huán)境微生物相同(除了鱖和短頜鱭偏低，約74%)。在約80%的個體中，95%以上的腸道微生物物種和OTU(分類操作單元)屬于過客類型。在魚類物種水平，99%以上的引入腸道的微生物物種和OTU是過客。水體環(huán)境微生物中近79%OTUs和89%物種可以被引入魚類腸道。受臨時微生物引入的驅(qū)動，具有相似棲息生境和食性的魚類具有相似的腸道微生物群落。(見習(xí)記者 荊淮僑)

關(guān)鍵詞： 長江野生魚 腸道內(nèi)微生物 環(huán)境微生物 量化環(huán)境微生物